ツールチップのフォントはカスタマイズできます。

ScottPlot.Plot myPlot = new();

double[] ys = Generate.Sin(50);
var plt = myPlot.Add.Signal(ys);
plt.MaximumMarkerSize = 20;

Coordinates tip = new(25, ys[25]);
Coordinates label = tip.WithDelta(8, .7);
var tooltip = myPlot.Add.Tooltip(tip, "こんにちは", label);
tooltip.LabelFontName = "Comic Sans MS";
tooltip.LabelFontSize = 36;
tooltip.LabelBold = true;

myPlot.SavePng("demo.png", 400, 300);